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    Protein Deglycosylation Kit Ⅰ (for O-linked Glycans)

    产品介绍

    背景:

    Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包含O-Glycosidase及α2-3,6,8,9 Neuraminidase,二者均是重要的糖基化研究的工具酶,组合用于糖蛋白O-连糖链的酶切释放。Rhinogen® O-Glycosidase能够将糖蛋白中Ser或Thr残基的羟基连接的Core 1(Gal-β(1-3)-GalNAc-)及Core 3(GlcNAc-β(1-3)-GalNAc-)O-连双糖释放下来,如图1。核心结构的任何修饰都可以阻断O-Glycosidase的作用,最常见的修饰是核心结构的单、二或三唾液酸化。Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase能够释放O-连糖链非还原末端α (2,3)-, α (2,6)-, α (2,8)-, α (2,9)-唾液酸残基,如图2,不同唾液酸残基的释放速率大致为α (2,6)->α (2,3)- >α (2,8)- >α (2,9)-。唾液酸酶的这种组合模式使得O-连糖链的酶切释放更彻底。该Kit包含的所有酶及试剂均与下游HPLC及MS兼容。

    QPF-0082(0092)

     图1. O-Glycosidase与α2-3,6,8,9 Neuraminidase组合用于糖蛋白O-连糖链的酶切释放

     QPF-0082

    图2. Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase作用位点

    包装规格:

    Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)包装规格如下:

    目录号

    组成

    规格

    体积

    QPF-008

    O-Glycosidase

    α2-3,6,8,9Neuraminidase

    1,200,000U

    0.6U

    30μl

    30μl

    配套试剂:

    Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)提供的配套试剂如下:

    试剂

    成分

    10×Denaturing缓冲液

    5%SDS,0.4M DTT

    10×Glyco缓冲液2

    0.5MSodium Phosphate(pH7.5 at 25°C)

    10%NP-40溶液

    10%NP-40

    产品来源:

    本试剂盒中的所有酶都是大肠杆菌BL21中表达并分离纯化的重组酶:O-Glycosidase分子量为147kDa;α2-3,6,8,9 Neuraminidase分子量为66KDa。

    产品质量:

    SDS-PAGE分析,纯度≥95%;没有检测到污染的糖苷外切酶、糖苷内切酶及蛋白酶活性。

    酶活定义:

    1个O-Glycosidase酶活力单位定义:在100μl反应体系中,37°C,pH7.5条件下,1小时内从5mg唾液酸酶消化后的非变性fetuin 上催化释放0.68nmol O-连二糖所需要的酶量。1U Rhinogen® O-Glycosidase =1 unit NEB O-Glycosidase。

    1个α2-3,6,8,9 Neuraminidase酶活力单位定义:在37°C,pH5.5条件下,以对硝基苯基-α-D-N-乙酰神经氨酸为底物,1分钟内催化释放1 μmol 对硝基苯酚所需要的酶量。1U Rhinogen® α2-3,6,8,9 Neuraminidase =1 U Prozyme Glyko® Sialidase ATM。

    储存条件: 

    -20°C。

    产品特点:

    Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)具有稳定性高、比活性高等特点,是两种高度纯化和非常稳定的糖苷酶的组合,适用于蛋白质组学及糖生物学研究中糖蛋白上常见O-连聚糖的有效释放。

    1. 高纯度:没有污染蛋白酶/其它糖苷酶,纯度≥95%;

    2. 高稳定性:每批Kit试剂盒中酶及试剂都经过严格的质量控制,以实现高稳定性;

    3. 高比活性:有效释放糖蛋白上唾液酸修饰O-连聚糖;

    4. HPLC、MS兼容:试剂盒中所有的酶及试剂与下游HPLC及MS兼容。

    应用:

    1. 聚糖结构分析;

    2. 结合位点及功能分析;

    3. 治疗性糖蛋白的表征及质量控制;

    4. 蛋白质组学分析,消除糖蛋白的异质性。

    使用建议:

    变性条件下去糖基化方案:

    1. 取10-100µg糖蛋白溶液,加入1µl 10×Denaturing缓冲液,补加纯化水使得反应体系为10µl;

    2. 将上述10µl体系100℃处理10min,使糖蛋白完全变性;

    3. 室温冷却5min;

    4. 在上述变性体系中,分别加入2µl 10×Glyco缓冲液2、2µl 10% NP-40溶液、1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,补加纯化水至反应总体积为50μl,轻柔混匀;

    5. 37°C 条件下反应1-5hr;

    注意:对于不同的糖蛋白样品,需要实验摸索最适的酶浓度及反应时间。

    非变性条件下去糖基化方案:

    1. 取10-100µg糖蛋白底物溶液,加入2µl 10×Glyco缓冲液2、纯化水及1-4μl O-Glycosidase、1-2μl α2-3.6.8.9Neuraminidase,使得总反应体积为20µl,轻柔混匀;

    2. 37°C 条件下反应1-4hr。

    注意:通常情况下,糖蛋白变性与否不显著影响O-连糖链去除的效率,但也不排除个例,建议根据自己的底物特性,选择合适的方法。

    当对天然糖蛋白去糖基化时,建议将等量糖蛋白样品进行变性后再同步进行酶切作为阳性对照,以确定非变性条件下去糖基化反应的程度。

    操作说明:

    1. 上述操作方法旨在为Rhinogen® Protein Deglycosylation KitⅠ(for O-linked Glycans)作为去糖基化试剂操作的一般指南,对于不同的糖蛋白样品,去糖基化活性高度依赖于反应条件,建议进行适当优化或根据经验确定最优的操作方法;

    2. 去糖基化体系可以线性放大或缩小;

    3. 由于变性缓冲液中含有SDS,而SDS会抑制Rhinogen® O-Glycosidase的活性,因此在变性糖蛋白反应体系中需加入终浓度为1%的NP-40,其能有效解除SDS对O-Glycosidase酶活的抑制;

    4. 本产品适用于天然或者变性糖蛋白,对于天然糖蛋白的去糖基化,可能需要更多的酶及更长的反应时间;

    5. EDTA、对氯丙基苯磺酸、Mn2+、Zn2+O-Glycosidase的酶活有一定的抑制作用,1mM各物质存在条件下,酶活回收率分别为63%、60%、44%、66%;

    6. 本产品仅供研究使用,不适用于人或动的物诊断及治疗用途。

    常见问题

    Q1:此试剂盒与下游HPLC及MS兼容吗?

    A1:是的,Rhinogen® Protein Deglycosylation Kit Ⅰ (for O-linked Glycans )所有的酶及缓冲试剂均与下游HPLC及MS应用兼容。可以采用微透析或微量过滤制备HPLC及MS分析的蛋白。


    Q2:使用O Glycosidase 处理 糖蛋白后,没有看到糖链的去除,可能的原因?

    A2:蛋白质的糖基化修饰有N-糖基化及O-糖基化修饰,O-Glycosidase 适用于释放 附着于Ser / Thr 的Core 1 和 Core 3 O-连接的二糖核心。如果底物中确定含有 O-糖链,请确保同时使用Neuraminidase,以释放末端的唾液酸修饰基团。同时 由于空间位阻效应(蛋白质的二级结构和三级结构)可以阻碍内切糖苷酶到达 其底物作用位点,在去糖基化之前进行变性有助于O-连聚糖有效的释放。如果 不想变性处理,则考虑添加更多的酶或延长孵育时间。


    Q3:在天然条件下释 放糖蛋白的糖 链,需要使用多 少Rhinogen® O Glycosidase?

    A3:当蛋白质不变性时,O-Glycosidase因为空间位阻效应可能难以到达糖链的酶切 位点(因为二级和三级蛋白质结构)。添加更多的酶量及延长反应时间可能有 助于糖链释放效率的提高,但对于不同的糖蛋白样品,去糖基化活性高度依赖 于反应条件,建议进行适当优化或根据经验确定最优的操作方法。


    Q4:是否可以同时使 用PNGase F、O Glycosidase 及α 2-3,6,8,9 Neuraminidase?

    A4:是的。Rhinogen® PNGase F 及 O-Glycosidase 采用相同的缓冲液及反应条件,而 α2-3,6,8,9 Neuraminidase 具有非常宽 pH 适用范围(pH4.5-8.5),在 PNGase F 及O-Glycosidase 反应体系中具有较好的活性,三者可以同时使用。

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